《消灭都市》的主线故事始终围绕神秘少女小雪和运输员拓也之间的羁绊而推进，在经历了二人携手寻找城市消失秘密的冒险后，全新故事和各位运输员们见面了。在这个世界里，二人的遭遇发生了反转，拓也居然失忆了，而小雪则深入虎穴来进行救援，虽然事态紧急，他们仍然配合精诚杀出重围。在调查员和极客的帮助下，“第二次消失”中的二人是否能够继续拯救世界呢？

【这一次拓也由我来拯救！】

《消灭都市》第一次消失的开始，拓也原本只是个普通的运输员，过着帮雇主运输货物来换取报酬的生活。然而某一天他接到了一个奇怪的任务，要运输的货物居然是一个神秘的少女，而在运输过程中，他们遭到了来自“念灵”的阻碍和攻击，从而开启了一段探寻三年前一座城市离奇消失秘密的冒险之旅。

在这段旅程中，拓也和小雪结下了深厚的羁绊，一个用精湛技术躲避路上的障碍与攻击，一个则专心对付念灵收编团队，可谓配合默契。

然而，在新的故事中，拓也成了在消失事件中的幸存者，但却丧失了记忆，而小雪在调查员和极客的帮助下找到了他的下落，独自闯入虎穴……这一次，拓也由小雪来拯救！

【失忆的运输员一样可以战斗！】

被小雪找到的拓也仍然对过去的事毫无印象，既不记得发生了什么，也不记得自己是谁。然而时间不等人，冲出重围后的二人发现念灵敌人已经紧追其后，那么，就先开始战斗吧！

和过去一样，运输员们仍然需要在躲避障碍的情况下收集晶球来与念灵作战，并且组建自己的念灵团队利用相克属性去达成最佳阵容。

在游戏过程中，运输员们可以通过简单的签到、主线任务、支线任务、限时任务、协力作战、排位战、挑战赛等多种途径获得念灵币，再用念灵币去前往召唤获得强力念灵，有事半功倍的效果。

“第二次消失”主线剧情公开后，新一批念灵与活动已经在赶来的路上，年末狂欢即将开幕，《消灭都市》运营组专门为大家准备了丰富的线上活动，关注官方微博@消灭都市，可以第一时间获取活动的通知，男神女神明星梯队组建不是梦！